• ፌስቡክ
  • linkin
  • youtube

1. መሰረታዊ እውቀት (የሙከራውን ክፍል ማየት ከፈለጉ እባክዎን በቀጥታ ወደ ሁለተኛው ክፍል ያስተላልፉ)

እንደ ተለምዷዊ PCR የመነሻ ምላሽ፣ የሪል ታይም ፒሲአር በዋናነት በእያንዳንዱ የፒሲአር ማጉላት ምላሽ በእያንዳንዱ ዑደት ውስጥ ያለውን የማጉላት ምርት መጠን በእውነተኛ ጊዜ በፍሎረሰንስ ሲግናል ለውጥ ይከታተላል እና የመነሻውን አብነት በመጠን በሲቲ እሴት እና በመደበኛ ከርቭ መካከል ባለው ግንኙነት ይተነትናል።

የ RT-PCR ልዩ ውሂብ ናቸው።መነሻ መስመር, የፍሎረሰንት ገደብእናየሲቲ እሴት

መነሻ፡ የ 3 ኛ-15 ኛ ዑደት የፍሎረሰንት እሴት መነሻ (መሰረታዊ) ነው, ይህም በመለኪያው አልፎ አልፎ በሚከሰት ስህተት ምክንያት ነው.
ገደብ (ገደብ): የሚያመለክተው በማጉላት ከርቭ ሰፊ የእድገት ክልል ውስጥ በተገቢው ቦታ ላይ የተቀመጠውን የፍሎረሰንስ ማወቂያ ገደብ ነው፣ ይህም በአጠቃላይ የመነሻ መስመር 10 እጥፍ ይበልጣል።
የሲቲ እሴት፡ በእያንዳንዱ የምላሽ ቱቦ ውስጥ ያለው የፍሎረሰንት እሴት ወደ ደረጃው ሲደርስ የ PCR ዑደቶች ብዛት ነው።
የሲቲ እሴቱ ከመጀመሪያው አብነት መጠን ጋር የተገላቢጦሽ ነው።

 በ1 ውስጥ ስለ siRNA አንዳንድ ተሞክሮ

ለ RT-PCR የተለመዱ የመለያ ዘዴዎች፡-

ዘዴ ጥቅም ጉድለት የመተግበሪያው ወሰን
SYBR አረንጓዴ Ⅰ ሰፊ ተፈጻሚነት፣ ሚስጥራዊነት፣ ርካሽ እና ምቹ የፕሪመር መስፈርቶች ከፍተኛ ናቸው, ለየት ያሉ ላልሆኑ ባንዶች የተጋለጡ ናቸው ለተለያዩ የዒላማ ጂኖች መጠናዊ ትንተና፣ በጂን አገላለጽ ላይ ምርምር እና በ transgenic recombinant እንስሳት እና ዕፅዋት ላይ ምርምር ለማድረግ ተስማሚ ነው።
ታክማን ጥሩ ልዩነት እና ከፍተኛ ተደጋጋሚነት ዋጋው ከፍ ያለ እና ለተወሰኑ ግቦች ብቻ ተስማሚ ነው. በሽታ አምጪ ተህዋስያንን መለየት, የመድሃኒት መከላከያ የጂን ምርምር, የመድሃኒት ውጤታማነት ግምገማ, የጄኔቲክ በሽታዎችን መመርመር.
ሞለኪውላር ቢኮን ከፍተኛ ልዩነት ፣ ፍሎረሰንት ፣ ዝቅተኛ ዳራ ዋጋው ከፍተኛ ነው, ለተወሰነ ዓላማ ብቻ ተስማሚ ነው, ዲዛይኑ አስቸጋሪ ነው, ዋጋውም ከፍተኛ ነው. የተወሰነ የጂን ትንተና, SNP ትንተና

ስለ siRNA in2 አንዳንድ ተሞክሮዎች አንዳንድ ስለ siRNA በ3 ውስጥ አጋጥሟቸዋል።

2. የሙከራ ደረጃዎች

2.1 ስለ የሙከራ ስብስብ- በቡድኑ ውስጥ ብዙ ጉድጓዶች ሊኖሩ ይገባል, እና ባዮሎጂያዊ ድግግሞሽ መሆን አለበት.

ባዶ ቁጥጥር በሙከራዎች ውስጥ የሕዋስ እድገት ሁኔታን ለመለየት ጥቅም ላይ ይውላል
አሉታዊ ቁጥጥር siRNA (ልዩ ያልሆነ የሲአርኤን ቅደም ተከተል) የ RNAi እርምጃን ልዩነት አሳይ።siRNA በ200nM ልዩ ያልሆነ የጭንቀት ምላሽ ሊያመጣ ይችላል።
የማስተላለፊያ ሬጀንት መቆጣጠሪያ ወደ ሴሎች የሚተላለፈው reagent መርዛማነት ወይም በታለመው ጂን አገላለጽ ላይ ያለውን ተጽእኖ አስወግድ
siRNA ከዒላማው ጂን ጋር የታለመውን ጂን አገላለጽ አንኳኩ።
⑤ (አማራጭ) አዎንታዊ siRNA የሙከራ ስርዓትን እና የአሰራር ችግሮችን ለመፍታት ጥቅም ላይ ይውላል
⑥ (አማራጭ) የፍሎረሰንት መቆጣጠሪያ siRNA የሕዋስ ሽግግር ውጤታማነት በአጉሊ መነጽር ሊታይ ይችላል

2.2 የፕሪመር ንድፍ መርሆዎች

የተራዘመ ቁራጭ መጠን ይመረጣል 100-150bp
የመጀመሪያ ደረጃ ርዝመት 18-25ቢፒ
የጂሲ ይዘት 30% -70% ፣ በተለይም 45% -55%
Tm ዋጋ 58-60 ℃
ቅደም ተከተል T / C ቀጣይነት ያለው ያስወግዱ;ኤ/ጂ ቀጣይነት ያለው
3 የመጨረሻ ቅደም ተከተል የ GC ሀብታም ወይም AT ሀብታም ያስወግዱ;ተርሚናል መሠረት G ወይም C ይመረጣል;ከቲ መራቅ የተሻለ ነው
ማሟያነት በፕሪመር ውስጥ ወይም በሁለት ፕሪመር መካከል ከ 3 በላይ መሠረቶች ተጨማሪ ቅደም ተከተሎችን ያስወግዱ
ልዩነት የፕሪመር ልዩነቱን ለማረጋገጥ ፍንዳታ ፍለጋን ተጠቀም

①ሲአርኤንኤ በዘር ላይ የተመሰረተ ነው, እና የተለያዩ ዝርያዎች ቅደም ተከተል የተለየ ይሆናል.

②ሲአርኤን በደረቀ ዱቄት የታሸገ ሲሆን ይህም በክፍል ሙቀት ለ2-4 ሳምንታት በተረጋጋ ሁኔታ ሊከማች ይችላል።

2.3 አስቀድመው መዘጋጀት ያለባቸው መሳሪያዎች ወይም ሬጀንቶች

ፕሪመር (ውስጣዊ ማጣቀሻ) ወደ ፊት እና ወደ ኋላ ሁለቱን ጨምሮ
ፕሪመርስ (የዒላማ ጂን) ወደ ፊት እና ወደ ኋላ ሁለቱን ጨምሮ
ዒላማ ሲ አር ኤን ኤ (3 ቁርጥራጮች) በአጠቃላይ ኩባንያው 3 ንጣፎችን ያዋህዳል እና ከሦስቱ አንዱን በ RT-PCR ይመርጣል
የማስተላለፊያ ኪት Lipo2000 ወዘተ.
አር ኤን ኤ ፈጣን ኤክስትራክሽን ኪት ከተዛወሩ በኋላ ለአር ኤን ኤ ማውጣት
ፈጣን የተገላቢጦሽ ጽሑፍ ስብስብ ለ cDNA ውህደት
PCR ማጉሊያ ኪት 2× ሱፐር SYBR አረንጓዴ
qPCR ማስተር ድብልቅ

2.4 በልዩ የሙከራ ደረጃዎች ውስጥ ትኩረት ሊሰጣቸው የሚገቡ ጉዳዮችን በተመለከተ፡-

①siRNA የመተላለፍ ሂደት

1. ለመለጠፍ 24-ጉድጓድ ሳህን ፣ 12-ጉድጓድ ሳህን ወይም 6-ጉድጓድ ሳህን መምረጥ ይችላሉ (በ 24-ጉድጓድ ሳህን ውስጥ በእያንዳንዱ የውሃ ጉድጓድ ውስጥ የቀረበው አማካይ የአር ኤን ኤ ክምችት ከ100-300 NG / uL ነው) እና የሴሎች ጥሩ የመተላለፊያ ጥግግት እስከ 60% -80% ወይም ከዚያ በላይ ነው።

2. የዝውውር ደረጃዎች እና የተወሰኑ መስፈርቶች በመመሪያው መሰረት በጥብቅ ናቸው.

3. ከተዛወረ በኋላ ናሙናዎችን በ24-72 ሰአታት ውስጥ ለኤምአርኤን ማወቂያ (RT-PCR) ወይም ፕሮቲን በ48-96 ሰአታት ውስጥ መሰብሰብ ይቻላል (WB)

② አር ኤን ኤ ማውጣት ሂደት

1. በውጫዊ ኢንዛይሞች መበከልን ይከላከሉ.በዋናነት ጭምብል እና ጓንት ማድረግን በጥብቅ ያካትታል;sterilized pipette ምክሮችን እና EP ቱቦዎች በመጠቀም;በሙከራው ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውለው ውሃ ከ RNase-ነጻ መሆን አለበት.

2. በፈጣን የማስወጫ ኪት ውስጥ በተጠቆመው መሰረት ሁለት ጊዜ እንዲደረግ ይመከራል, ይህም ንፅህናን እና ምርትን በእውነት ያሻሽላል.

3. የቆሻሻ ፈሳሹ የ RNA አምድ መንካት የለበትም.

③ አር ኤን ኤ መጠን

አር ኤን ኤ ከተወጣ በኋላ በቀጥታ በናኖድሮፕ ሊለካ ይችላል፣ እና ዝቅተኛው ንባብ እስከ 10ng/ul ዝቅተኛ ሊሆን ይችላል።

④ የጽሑፍ ግልባጭ ሂደት

1. በ RT-qPCR ከፍተኛ ስሜታዊነት ምክንያት ለእያንዳንዱ ናሙና ቢያንስ 3 ትይዩ ጉድጓዶች መደረግ አለባቸው ተከታዩ Ct በጣም የተለየ እንዳይሆን ወይም ኤስዲው ለስታቲስቲክስ ትንተና በጣም ትልቅ እንዳይሆን።

2. አትቀዘቅዙ እና የማስተር ድብልቅን ደጋግመው አይቀልጡት።

3. እያንዳንዱ ቱቦ/ቀዳዳ በአዲስ ጫፍ መተካት አለበት!ናሙናዎችን ለመጨመር ተመሳሳይ የ pipette ጫፍን ያለማቋረጥ አይጠቀሙ!

4. ናሙናውን ከጨመረ በኋላ በ 96 ጉድጓድ ላይ የተጣበቀው ፊልም በጠፍጣፋ ማረም ያስፈልጋል.በቧንቧ ግድግዳ ላይ ያለው ፈሳሽ ወደታች እንዲፈስ እና የአየር አረፋዎችን ለማስወገድ በማሽኑ ላይ ከማስቀመጥዎ በፊት ሴንትሪፉል ማድረግ ጥሩ ነው.

⑤የጋራ ኩርባ ትንተና

የሎጋሪዝም እድገት ጊዜ የለም። አብነት ከፍተኛ ትኩረት ሊሆን ይችላል።
ምንም የሲቲ እሴት የለም። የፍሎረሰንት ምልክቶችን ለመለየት የተሳሳቱ እርምጃዎች;
የፕሪመር ወይም የፍተሻዎች መበላሸት - ታማኝነቱ በ PAGE ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ሊታወቅ ይችላል;
በቂ ያልሆነ የአብነት መጠን;
አብነቶችን ማበላሸት - በናሙና ዝግጅት ውስጥ ቆሻሻዎችን ማስተዋወቅ እና ተደጋጋሚ ማቀዝቀዝ እና ማቅለጥ;
ሲቲ>38 ዝቅተኛ የማጉላት ውጤታማነት;PCR ምርት በጣም ረጅም ነው;የተለያዩ ምላሽ አካላት ተበላሽተዋል
መስመራዊ የማጉላት ኩርባ በተደጋጋሚ በሚቀዘቅዙ ዑደቶች ወይም ለረጅም ጊዜ ለብርሃን መጋለጥ ምርመራዎች በከፊል ሊበላሹ ይችላሉ
የተባዙ ጉድጓዶች ልዩነት በተለይ ትልቅ ነው የምላሽ መፍትሄው ሙሉ በሙሉ አይቀልጥም ወይም የምላሽ መፍትሄው አልተቀላቀለም;የ PCR መሳሪያው የሙቀት መታጠቢያ ገንዳ በፍሎረሰንት ንጥረ ነገሮች ተበክሏል

2.5 ስለ መረጃ ትንተና

የqPCR መረጃ ትንተና ወደ አንጻራዊ አሃዛዊ እና ፍፁም አሃዝ ሊከፋፈል ይችላል።ለምሳሌ, በሕክምና ቡድን ውስጥ ያሉ ሴሎች በቁጥጥር ቡድን ውስጥ ካሉ ሴሎች ጋር ሲወዳደሩ,

የ X ጂን mRNA ስንት ጊዜ ይለወጣል, ይህ አንጻራዊ መጠን ነው;በተወሰኑ የሴሎች ቁጥር, የ X ጂን mRNA

ምን ያህል ቅጂዎች አሉ, ይህ ፍጹም መጠን ነው.አብዛኛውን ጊዜ በቤተ ሙከራ ውስጥ የምንጠቀመው አንጻራዊ የቁጥር ዘዴ ነው።በተለምዶ፣የ 2-ΔΔct ዘዴበሙከራዎች ውስጥ በብዛት ጥቅም ላይ ይውላል, ስለዚህ ይህ ዘዴ ብቻ እዚህ በዝርዝር ይተዋወቃል.

2-ΔΔct ዘዴ: የተገኘው ውጤት በሙከራ ቡድን ውስጥ ካለው የጂን ዘረ-መል (ጅን) ጋር ሲነፃፀር በክትትል ቡድን ውስጥ ያለው ልዩነት ነው.የሁለቱም የታለመው ዘረ-መል እና የውስጣዊ ማመሳከሪያ ጂን የማጉላት ቅልጥፍና ወደ 100% የሚጠጋ ሲሆን አንጻራዊው ልዩነት ከ 5% መብለጥ የለበትም.

የማስላት ዘዴው እንደሚከተለው ነው.

Δct የቁጥጥር ቡድን = በቁጥጥር ቡድን ውስጥ የዒላማ ዘረ-መል (CT) እሴት - በቁጥጥር ቡድን ውስጥ የውስጣዊ ማመሳከሪያ ጂን ct እሴት

Δct የሙከራ ቡድን = በሙከራ ቡድን ውስጥ ያለው የታለመው ዘረ-መል (CT) እሴት - በሙከራ ቡድን ውስጥ ያለው የውስጣዊ ማመሳከሪያ ጂን ሲቲ እሴት

ΔΔct=Δct የሙከራ ቡድን-Δct መቆጣጠሪያ ቡድን

በመጨረሻም፣ በገለፃ ደረጃ ያለውን የልዩነት ብዜት አስሉ፡

ማጠፍ=2-ΔΔct ቀይር (ከኤክሴል ተግባር ጋር የሚዛመደው POWER ነው)

ተዛማጅ ምርቶች፡

የሕዋስ ቀጥታ RT-qPCR ስብስብ
በ4 ውስጥ ስለ siRNA አንዳንድ ተሞክሮ


የልጥፍ ሰዓት፡- ግንቦት-20-2023